制御プログラムの不具合でエンジンから黒煙が出る可能性があるとして、トヨタ自動車は2016年11月24日、10年7月から16年7月までに製造されたハイエースなど4車種計24万3907台のリコール（回収・無償修理）を国交省に届け出た。
ほかに3車種7万台も届け出
世界で活躍するトヨタ車（記事とは直接関係ありません）
ハイエースのほかの3車種は、レジアスエース、ダイナ、トヨエース。
また、シフトレバーも壊れる可能性があるとして、2009年12月～12年4月に製造されたハイエース、レジアスエース、トヨタ救急車の3車種計7万4808台のリコールも届け出た。